首先在开始菜单打开控制面板。点击开始,选择右侧的控制面板。
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在控制面板中,以所有控制面板的格式查看,选择管理工具,并打开。
在管理工具中,可以看到有个数据源(ODBC),打开数据源。
在数据源管理面板中,选择添加,由于我这里已经添加了一个数据源,只是介绍一下操作。
根据自己的数据库,选择相应的驱动,比如我这里是MYSQL ODBC 5.3。点击完成,进行下一步的配置。
这里根据提示,填写相应的字段即可。最后点击OK,由于这里没有填写任何字段,所以OK按钮是灰色的。
打开R软件,数据源设置好了之后,还要加载RODBC包。如果没有安装,参考经验“R语言关于R包的管理:安装加载查看,移除,卸载”。回车之后没有错误提示便是成功了。
、使用R数据库接口
连接MySQL,使用RMySQL包,使用前RMySQL包要先安装。
library(RMySQL)
连接方式有2种:
(1)使用dbConnect
conn - dbConnect(MySQL(), dbname = "rmysql", username="rmysql", password="rmysql", host="127.0.0.1", port=3306)
数据操作方法:
dbWriteTable(conn, "tablename", data) #写表
一些常用的数据,处理好,放在mySQL里,以后使用起来也方便。
可以用R直接进行分析,具体步骤如下:
1、R下载RODBC包,安装好。
下载mySQL ODBC,安装好。
3、windows:控制面板-管理工具-数据源(ODBC)-双击-添加-选中mysql ODBC driver一项
填写:data source name 一项填入你要使用的名字,自己随便命名,例如:mysql_data;
description一项随意填写,例如mydata
TCP/IP Server 填写本机服务器IP,一般为:127.0.0.1
user 填写你的mysql用户名
password 填写你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库,选择一个数据库。
确定。
4、打开R的界面调用数据库:
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library(RODBC); channel - odbcConnect("mysql_data", uid="root",pwd="123"); sqlTables(channel);#查看数据中的表 data-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的内容,存到数据框里
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