Linux文本操作常用命令

在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：

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通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）

接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：

参数的用法介绍：

注意事项：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看

结合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比较少

3.1 less命令

less [参数] 文件名

less命令重要的补充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键

less命令重要的补充用法2 ：

参数用法：

less命令 不加参数 查看文件：

less命令加 -N参数 查看文件：显示行号

less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整

对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好

查看压缩文件

wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。

常见参数:

切记：用less命令，按q退出

cut命令是按关键词来切的

常见参数:

排列前：

排列后：

解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。

uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

换其它文件试试

总之，uniq命令使用时经常和sort一起

常见参数:

常见用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常见用法2 : paste - -

常见参数:

要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容

3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列

4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计

5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符

补充小知识 ：

清屏 ：control L

查看历史（输入过的）命令 ：history

linux中的命令如何输入

需要在终端中输入命令进行操作，打开终端有如下4种方法，建议你这样试试看：

1. 快捷键，“Ctrl + Alt + T”, 打开终端，输入命令，如 ls，

2. 点击搜索计算机，然后输入终端，点击，即可打开终端，

3. 进入任意文件夹下，点击右键，选择“在终端打开”，即可打开该路径下的终端，

4. 点击桌面左侧的终端快捷键，

然后在终端输入linux命令，如：ls，whoami, pwd, 等等。

linux基本操作命令

linux基本操作命令：pwd命令、cd命令、ls命令、cat命令、cp命令。

1、pwd命令

使用pwd命令找出您所在的当前工作目录的路径。该命令将返回一个绝对（完整）路径，该路径基本上是所有以/开头的目录的路径。绝对路径的一个示例是/home/username。

2、cd命令

要浏览Linux文件和目录，请使用cd命令。根据您所在的当前工作目录，它需要目录的完整路径或名称。假设您位于/home/username/Documents中，并且想要转到Documents的子目录Photos。

3、ls命令

LS命令用于查看目录的内容。默认情况下，此命令将显示当前工作目录的内容。如果要查看目录的内容，请键入ls，然后键入目录的路径。

4、cat命令

cat（连接的缩写）是Linux中最常用的命令之一。它用于在标准输出（sdout）上列出文件的内容。要运行此命令，请键入cat，然后输入文件名及其扩展名。

5、cp命令

使用cp命令将文件从当前目录复制到另一个目录。例如，命令cpscenery.jpg/home /username/Pictures将在您的Pictures目录中创建一个Scene.jpg副本（来自当前目录）。

linux基本命令

[root@localhost ~]#

用户 @ 主机名 当前目录

总结Linux命令输入规律：

如何输入命令：

命令 [选项]（[参数]）[选项的值]（[参数的值]）空格分割

常见选项（参数）：-h --help ； 特点：选项前有一个 -字母 或 --加单词

例：find /home -name mk

命令后：左边是源 右边是目标

例：cp a.txt a.txt.bak

作用：查看目录下的文档

语法：ls 目录

-l 显示详细信息

-a 显示隐藏文件

. 当时目录

.. 上级目录

-d 查看目录

-h 增强可读性

作用：查看当前所在的路径

语法：pwd

例：[root@iZ9403omxhxZ html]# pwd

/var/www/html

作用：切换目录

语法：cd 目录名

cd 回到用户的家目录

cd ~ 回到-用户的家目录

cd - 回到上级切换时目录

切换到/etc下

[root@localhost html]# cd /etc/

切换到/etc/sysconfig/

[root@localhost sysconfig]# cd /etc/sysconfig/

-h --help

man find

shutdow、init 、reboot

作用：关机，重启，定时关机

-r #重启

-h #关机

-h +2 # 2分钟后关机

-c

shutdown -h 22:00

作用：切换系统级别

语法：init 0~6

init 0命令用于立即将系统运行级别切换为0，即关机；

init 6命令用于将系统运行级别切换为6，即重新启动。

0是关机

1是单用户

2是多用户，不联网

3是多用户

4是不使用的

5是xwindows，也就是有界面的

6是重启

自己去查下reboot怎么使用吧，这里就不过多介绍了reboot --help

[root@localhost~]# runlevel

N 3

语法：

ln(选项)(参数)

它的功能是为某一个文件在另外一个位置建立一个同不的链接，这个命令最常用的参数是-s，具体用法是：ln –s 源文件 目标文件。

在此我们只介绍下软链接。

我们为js文件夹建一个软链接

我们为/var/www/html/forestry/js/ 在/root/目录下建立一个名叫js2的软链接。

图中我们可以看到js2的连接目录是/var/www/html/forestry/js/